Er wurde am 15. Februar 1926 in Strelitz, heute Neustrelitz wegen Mordes, den er nicht begangen hatte, zum Tod verurteilt und enthauptet.
Einer der bedeutendsten Justizirrtümern in der deutschen Rechtsgeschichte des 20. Jahrhunderts ist der Fall Josef Jakubowski.

Niemand in dem mecklenburgischen Heidedorf Palingen hätte dem Knecht Josef Jakubowski etwas Schlechtes zugetraut. Er war doch stets ein guter Mensch, sagen die Leute. Hat er damals nicht die Ida genommen, obwohl sie ein Kind von einem anderen bekam? Und hat er nicht immer für den kleinen Ewald gesorgt,

 1963 wurde zum Andenken an die Ermordung von Josef Jakubowski an der alten Schule ein Denkmal errichtet, welches bis heute noch erhalten ist.